日阿根廷队开始了南美超级杯赛前的训练，在训练时梅西中途退出，疑似因雾霾太大而感到身体不适。11月23日在西甲联赛第十二轮巴萨对塞维利亚的比赛上，梅西完成帽子戏法。此役过后，梅西凭借二百五十三粒进球正式加冕西甲第一射手，12月20日梅西被iffhs评为2013年世界职业联赛的最佳射手奖。



2004年6月梅西首次代表阿根廷国家级球队出战。



里奥·梅西2005年阿根廷夺取世青赛冠军，梅西赢得了金球和金靴双料大奖。2006年世界杯上，梅西并未完全的重用，首战科特迪瓦他未获出场机会，次战塞黑他在第七十四分钟替补马克西·罗德里格斯登场，成为代表阿根廷在世界杯登场的最年轻球员，而那场比赛中他还有进球，小组末轮对荷兰，梅西首发但无表现，淘汰赛阶段，他在对墨西哥时替补出场，而对德国一战则没有得到上场机会。