撕裂而不得不休息一月之久。2009-10赛季受伤病影响，伊涅斯塔对球队的贡献有所减少，代表巴塞罗那在各项赛事中出场四十二次，打入一个进球。



2011年5月29日巴塞罗那在欧冠决赛赛场上三比一击败了2009年的老对手曼联，伊涅斯塔在比赛中助攻梅西打入超出比分的一粒进球。2010-11赛季伊涅斯塔帮助巴塞罗那完成了西甲三连冠，同时国王杯也闯入决赛，他代表巴塞罗那在各项赛事中出场四十七次，打入八个进球。



2011年8月26日伊涅斯塔帮助巴塞罗那在欧洲超级杯决赛中二比零战胜波尔图夺得冠军。12月18日伊涅斯塔帮助巴塞罗那在世俱杯决赛中四比零战胜桑托斯夺得冠军，这一荣誉使得巴塞罗那成为2011年度五冠王。2012年4月15日巴塞罗那客场二比一逆转莱万特，伊涅斯塔完成俱乐部正式赛事四百场里程碑，2011-12赛季伊涅斯塔代表巴塞罗那在各项赛事中出场四十三次，打入五个进球。



2012年8月31日伊涅斯塔当选为2011-12赛季欧足联欧洲最佳球员。2013年6月2日伊涅斯塔帮助巴塞罗那四比一战胜马拉加并打进一球奉献一次助攻，赢得了这个赛季的西甲收官战，最终球队以三十二胜四平两负积一百分，领先第二名皇家马德里十五分的成绩夺冠，2012-13赛季伊涅斯塔代表巴塞罗那在各项赛事中出场四十八次，打入六个进球。