数千年前，在铁器时代之后，雷吉奇卡斯被封印在神奥地区的切锋神殿。雷吉洛克、雷吉艾斯、雷吉斯奇鲁分别被封印在丰缘地区的各个遗迹之中。



大约3000年前，卡洛斯地区发生了战争。在这场战争中，卡洛斯的王az失去了自己心爱的花叶蒂。为了让花叶蒂复活，az发明了“最终兵器”。



“最终兵器”释放出的能量使az和花叶蒂得到了永恒的生命。虽然复活成功，但愤怒的az又向战争双方复仇。用“最终兵器”毁灭了一切，给卡洛斯地区带来巨大的灾难。



而花叶蒂得知“最终兵器”是牺牲了大量的神奇宝贝而驱动的之后，失望的了离开了az。



再次失去花叶蒂的az痛苦万分，但永恒的生命让他无法自尽。于是痛苦的az便踏上了寻找花叶蒂的流浪之旅。



2500年前，合众地区古代城堡建成。



约1500年前，最早的文字出现在城都地区的阿露福遗迹、七之岛的阿斯卡纳遗迹以及神奥地区的随意遗迹中。至今考古学家还不能确定未知图腾和这种文字哪个出现的更早。但显然它们之间存在有某种关联。



同时期，大葱鸭因为过度捕猎而减少。鲤鱼王的种群发生突变，基因变得菜的抠脚。



约800年前，哲尔尼亚斯和伊裴尔塔尔在卡洛斯地区陷入沉睡。



4近代



约700年前，铃铛塔和钟之塔在圆朱市建成。两座塔象征着宝可梦和人类的友谊，洛奇亚与凤王栖息于塔顶。



约500年前，阿佐特王国的天才科学家艾利法斯制造出玛机雅娜献给了王室，与当时的公主一起生活。



约300年前，当时的卡洛斯国王为了炫耀自身权力，建造了巴尔法姆香殿。



约150年前，钟之塔被雷击燃起大火。洛奇亚飞去了漩涡列岛，有三只宝可梦在大火中丧生。大火熄灭后，凤王出现，让三只被烧死的神奇宝贝复活，称为传说中的三圣兽：炎帝、雷公、水君。



大约在同时期，第一场神奇宝贝联盟大赛举行。



约100年前，电石洞穴开始出现齿轮儿。



1925年，宝可梦学的开创者——西野森博士进行了一场抽取火暴猴愤怒能量的实验。但年迈的教授搞错了火暴猴的用药剂量，使火暴猴变得过度衰弱。或许使出于生存的本能，火暴猴缩到了教授的老花眼镜盒里。像胎儿一样，团成了圆形。



这次事件成为了宝可梦捕获胶囊开发的契机。



之后又经过了数次改良，最终成为了市面上贩卖的现代精灵球。



5现代



现代发生的事件就是各个游戏内的主要剧情，不多赘述。